More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4782 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1976  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.37 
 
 
687 aa  934    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0310  oxidoreductase, FMN-binding  92.42 
 
 
686 aa  1309    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019532  hitchhiker  0.00413942 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0707  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.37 
 
 
687 aa  934    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0058  stachydrine utilization oxidoreductase protein  63.23 
 
 
687 aa  917    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.78 
 
 
680 aa  685    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  77.23 
 
 
688 aa  1108    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388153  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4017  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  80.26 
 
 
686 aa  1153    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  99.13 
 
 
686 aa  1414    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0474  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.37 
 
 
687 aa  934    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4041  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.02 
 
 
680 aa  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117135  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4782  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
686 aa  1420    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3746  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.32 
 
 
680 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0759587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.5 
 
 
686 aa  910    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697936  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4819  NADH:-lavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.66 
 
 
687 aa  930    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.46 
 
 
680 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4897  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93.15 
 
 
686 aa  1316    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616438  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.37 
 
 
687 aa  934    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  95.04 
 
 
686 aa  1363    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0331  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  92.42 
 
 
686 aa  1309    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907336  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0574  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.24 
 
 
687 aa  900    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3549  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.66 
 
 
687 aa  896    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  92.57 
 
 
686 aa  1311    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6185  putative FMN oxidoreductase  91.69 
 
 
686 aa  1314    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5066  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.83 
 
 
687 aa  950    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671736  normal  0.0284931 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1865  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  64.1 
 
 
687 aa  941    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.715282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  92.71 
 
 
686 aa  1339    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.02 
 
 
680 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1582  NADH-flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  64.97 
 
 
687 aa  954    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0831  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.37 
 
 
687 aa  934    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.26 
 
 
694 aa  1139    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3286  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.81 
 
 
687 aa  896    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5203  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.95 
 
 
687 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.9 
 
 
678 aa  657    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.95 
 
 
687 aa  897    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231835  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.37 
 
 
687 aa  940    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71260  putative FMN oxidoreductase  92.13 
 
 
686 aa  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0743  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.37 
 
 
687 aa  934    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.81 
 
 
687 aa  896    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1003  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.37 
 
 
687 aa  934    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.95 
 
 
687 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467216  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4753  N-methylproline demethylase, putative  42.57 
 
 
678 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3207  hypothetical protein  42.71 
 
 
678 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.519422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 
702 aa  555  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 
678 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309437  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1197  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 
678 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.415933  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.42 
 
 
678 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1528  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.92 
 
 
681 aa  544  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.124714 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.07 
 
 
681 aa  534  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3416  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.42 
 
 
678 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623509  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.79 
 
 
686 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.23 
 
 
677 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.94 
 
 
684 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5525  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.04 
 
 
686 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215393  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3681  putative NADH-dependent oxidase  43.15 
 
 
688 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0197334  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5465  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.21 
 
 
690 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663425  normal  0.914634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2254  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.08 
 
 
664 aa  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4278  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.87 
 
 
661 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.46 
 
 
653 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.7 
 
 
650 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2869  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.3 
 
 
650 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2820  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.3 
 
 
650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1844  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.22 
 
 
671 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71592  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3861  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.74 
 
 
651 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5721  putative oxidoreductase  31.05 
 
 
648 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.65 
 
 
667 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65940  putative oxidoreductase  30.9 
 
 
648 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2912  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.86 
 
 
650 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.07 
 
 
646 aa  292  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
654 aa  290  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.73 
 
 
646 aa  289  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.62 
 
 
665 aa  286  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.35 
 
 
644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.8 
 
 
668 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.93 
 
 
652 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0797  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.88 
 
 
676 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369713  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.55 
 
 
667 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1488  NADH:flavin oxidoreductase  32.61 
 
 
656 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.56 
 
 
682 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1303  NADH:flavin oxidoreductase  32.93 
 
 
671 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4931  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.14 
 
 
641 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.5 
 
 
635 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.691445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.78 
 
 
671 aa  267  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  31.05 
 
 
650 aa  266  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.39 
 
 
647 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4819  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.63 
 
 
661 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.7 
 
 
725 aa  263  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.31 
 
 
671 aa  261  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.19 
 
 
671 aa  261  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000426277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.81 
 
 
669 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5997  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.12 
 
 
667 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0537  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  32.48 
 
 
684 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.45506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  32.58 
 
 
670 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  32.58 
 
 
670 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.46 
 
 
937 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2016  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.53 
 
 
687 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3687  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.43 
 
 
679 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3539  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.8 
 
 
673 aa  254  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1515  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.49 
 
 
686 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.2 
 
 
670 aa  253  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.78 
 
 
646 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>