196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4707 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  72.3 
 
 		 152 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  50.65 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  48.65 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  49.67 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  47.71 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  49.34 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  49.65 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  48.68 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  42.66 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  45.52 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  48.12 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  43.38 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  43.38 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  43.26 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  51.16 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  28.08 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  28.37 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  28.47 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  30.5 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  32.89 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  36.61 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  28.15 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  29.41 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.61 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  27.74 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  29.41 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  30.08 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  39.36 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  29.5 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  26.43 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  26.43 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  25.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  25.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  25.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  28.86 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.13 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  33.33 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  31 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  28.89 
 
 		 340 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3485  hypothetical protein  23.13 
 
 		 260 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  30.23 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0902  hypothetical protein  22.45 
 
 		 250 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  26.98 
 
 		 312 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.06 
 
 		 1345 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.06 
 
 		 1372 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  24.64 
 
 		 338 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  38.67 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  26.81 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  30.36 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  31.43 
 
 		 320 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  24.6 
 
 		 314 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  31.46 
 
 		 335 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  25.93 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2620  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000852823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  25.35 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  27.69 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  25.15 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  24.34 
 
 		 219 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  26.72 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  32.95 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  34.88 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13701  hypothetical protein  28.47 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  20.25 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  27.45 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  28.24 
 
 		 323 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  28.89 
 
 		 335 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  24.63 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  23.97 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  27.5 
 
 		 236 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  25 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  24.48 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  33.66 
 
 		 323 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  25.71 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  31.82 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  35.53 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  27.61 
 
 		 304 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  28.21 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  32.58 
 
 		 325 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  23.88 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  29.25 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  24.63 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  26.56 
 
 		 312 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  31.11 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  27.41 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  27.55 
 
 		 236 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>