More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4618 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  100 
 
 
209 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  99.04 
 
 
209 aa  415  1e-115  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  92.34 
 
 
209 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  87.56 
 
 
210 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  86.6 
 
 
210 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  89.95 
 
 
209 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  89.95 
 
 
209 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  89.95 
 
 
209 aa  362  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  89.95 
 
 
209 aa  362  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  81.82 
 
 
209 aa  328  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.11 
 
 
210 aa  224  5e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
210 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
210 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 
213 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
213 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
209 aa  199  2e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 
214 aa  196  2e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
216 aa  189  3e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
211 aa  188  6e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
210 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
235 aa  181  5e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
214 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  43.54 
 
 
215 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
213 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 
210 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 
210 aa  178  5e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 
214 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  43.06 
 
 
210 aa  177  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
210 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
215 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
215 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
215 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
216 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
210 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
215 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
215 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
211 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 
216 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 
215 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
239 aa  174  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 
210 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
210 aa  174  1e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
215 aa  172  2e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
215 aa  173  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
215 aa  172  3e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
215 aa  172  3e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
215 aa  172  4e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
214 aa  172  4e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
215 aa  172  4e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
210 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 
210 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
214 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
210 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 
215 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
215 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
218 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
215 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
209 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
215 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
215 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
215 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
215 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
214 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
212 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
215 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
215 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 
282 aa  166  3e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
210 aa  166  3e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
215 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
215 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
215 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
215 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 
210 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
210 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
210 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  44.29 
 
 
215 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 
218 aa  162  4e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
215 aa  162  4e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 
215 aa  162  5e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 
215 aa  162  5e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
210 aa  160  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
206 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
209 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
208 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 
236 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
209 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
210 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
226 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
218 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
209 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
209 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  38.57 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.06395e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36.36 
 
 
214 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
211 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  37.14 
 
 
214 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  37.14 
 
 
214 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  37.14 
 
 
214 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  7.50596e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  37.14 
 
 
214 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
218 aa  155  5e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>