28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4510 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.35 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  36.42 
 
 		 401 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  32.24 
 
 		 425 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 422 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.38 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.83 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.22 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.32 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.36 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.97 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  28.7 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.35 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  27.59 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  27.74 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  29.11 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.56 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.21 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  23.56 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.85 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  26.6 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.05 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.02 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  30.46 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>