More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4499 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 706 aa  1437    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 		 707 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 		 707 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  39.88 
 
 		 707 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  39.52 
 
 		 738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 		 742 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 727 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  38.26 
 
 		 726 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 		 728 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 		 727 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  35.39 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 		 685 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 702 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 702 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.55 
 
 		 705 aa  258  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 811 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 811 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 743 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 742 aa  241  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 698 aa  240  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 743 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 743 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 743 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 743 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 712 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 805 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 729 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 710 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 729 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 737 aa  232  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 819 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 727 aa  230  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 710 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 708 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 809 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 774 aa  228  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 716 aa  226  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 718 aa  224  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 726 aa  224  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 750 aa  223  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 772 aa  223  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.25 
 
 		 704 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 728 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 772 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 772 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 724 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 708 aa  212  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 719 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 728 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 710 aa  204  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 802 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.42 
 
 		 737 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 761 aa  197  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  27.62 
 
 		 804 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  28.51 
 
 		 720 aa  196  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  27.47 
 
 		 804 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 757 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  28.3 
 
 		 763 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 768 aa  195  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 731 aa  195  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.76 
 
 		 746 aa  194  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 722 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 729 aa  193  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.19 
 
 		 724 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 729 aa  191  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 722 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 759 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 800 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 730 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 754 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 808 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 755 aa  182  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 801 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  27.34 
 
 		 744 aa  180  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 801 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 728 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  26.97 
 
 		 771 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 729 aa  178  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 764 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 804 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.81 
 
 		 680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 768 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 725 aa  174  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 823 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 734 aa  171  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  27.23 
 
 		 693 aa  170  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 714 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  26.17 
 
 		 804 aa  168  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  26.82 
 
 		 697 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 756 aa  167  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 713 aa  164  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 761 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 709 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  25.96 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>