173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4496 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  100 
 
 		 237 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  45.3 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  45.3 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  38 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  39.68 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  35.71 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  46.59 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40.62 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  45.57 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  39.81 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  39.53 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.71 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.91 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  40.7 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  39.29 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  42.17 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  40.48 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  41.18 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  43.04 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  42.17 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.27 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  41.18 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  40.48 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  42.17 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  43.53 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  42.17 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  42.17 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  40 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  42.17 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  40.48 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  42.17 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  41.77 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  34.13 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  37.21 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  34.55 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  43.02 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.78 
 
 		 280 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  40.48 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  33.6 
 
 		 283 aa  62  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  40 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  38.1 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  36.56 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  39.08 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  35 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  41.25 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  39.08 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  32.94 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  40.24 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  40.48 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  39.08 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  34.62 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  40.96 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  40.96 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  40.96 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  36.05 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  34.62 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  34.62 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  38.37 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  38.37 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  41.03 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  34.62 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  34.62 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  34.62 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  39.76 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.5 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  35.9 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  31.45 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  36.14 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  39.76 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.98 
 
 		 117 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  37.5 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  41.77 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  36.14 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  38.64 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  34.18 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  29.96 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  36.59 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  30 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  38.75 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  42.17 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.56 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  35.44 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  32.94 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  38.75 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  42.17 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  38.96 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  35 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  34.12 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.97 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  32.87 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  28.75 
 
 		 112 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  40.74 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  30.23 
 
 		 271 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  36.05 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  33.33 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  35 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>