246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4421 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  56.58 
 
 
152 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  50.65 
 
 
152 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  51.35 
 
 
151 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  49.66 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  53.69 
 
 
151 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  53.38 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  44.59 
 
 
151 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  48.68 
 
 
150 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  46.94 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  53.28 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  49.61 
 
 
184 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  51.39 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  45.33 
 
 
151 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  47.22 
 
 
153 aa  134  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  44 
 
 
151 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  42.45 
 
 
151 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  41.43 
 
 
150 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  48.84 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  34.97 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  37.3 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  31.75 
 
 
322 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.24 
 
 
1372 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.63 
 
 
1345 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  29.23 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.85 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  24.64 
 
 
338 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  28.35 
 
 
323 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  24.81 
 
 
335 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  28.35 
 
 
241 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  25.9 
 
 
335 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  29.23 
 
 
323 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.37 
 
 
236 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  31.85 
 
 
224 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  30.5 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  25.95 
 
 
340 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  26.19 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  36.73 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  27.64 
 
 
230 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  28.89 
 
 
319 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  32.94 
 
 
282 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  29.13 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  31.43 
 
 
232 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  30.43 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  25.37 
 
 
253 aa  57.4  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  25.37 
 
 
253 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  32.94 
 
 
305 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  25.55 
 
 
325 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  32.58 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  38.67 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  25.2 
 
 
326 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  32.94 
 
 
232 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  26.81 
 
 
325 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  25.4 
 
 
312 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  26.83 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  26.83 
 
 
230 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  26.09 
 
 
334 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  26.83 
 
 
230 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  26.19 
 
 
316 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  26.32 
 
 
287 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  24.24 
 
 
323 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  30.4 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  25.81 
 
 
251 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  32.09 
 
 
216 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  27.48 
 
 
188 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  27.01 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
214 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2563  protein of unknown function DUF1568  25.78 
 
 
248 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  28.23 
 
 
241 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  28.74 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  32.26 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  31.76 
 
 
230 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  25.98 
 
 
321 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  24.35 
 
 
236 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  24.64 
 
 
295 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  28.08 
 
 
239 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  33.72 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  30.39 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  30.95 
 
 
326 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  25.33 
 
 
181 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  24.64 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  23.7 
 
 
327 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  30.22 
 
 
233 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  32.94 
 
 
228 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  31.15 
 
 
235 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  25.53 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  32.1 
 
 
248 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  32.14 
 
 
248 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2161  hypothetical protein  30.88 
 
 
295 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  25.58 
 
 
252 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  29.76 
 
 
316 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  33.72 
 
 
231 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>