More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4333 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  100 
 
 
297 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  94.61 
 
 
297 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  78.45 
 
 
298 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  71.62 
 
 
298 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  70.61 
 
 
298 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  70.14 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  69.79 
 
 
290 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  70.14 
 
 
290 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  67.24 
 
 
292 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  70.14 
 
 
290 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  64.48 
 
 
293 aa  359  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  48.08 
 
 
302 aa  275  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  48.11 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  45.67 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  48.1 
 
 
301 aa  271  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  48.43 
 
 
302 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  47.18 
 
 
300 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  45.83 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 
293 aa  262  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  44.79 
 
 
300 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  45.83 
 
 
300 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  45.83 
 
 
300 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  45.83 
 
 
300 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  44.79 
 
 
300 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  44.79 
 
 
300 aa  261  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  44.79 
 
 
300 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  44.79 
 
 
300 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  44.79 
 
 
300 aa  261  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  44.79 
 
 
300 aa  261  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  44.79 
 
 
300 aa  261  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  44.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  45.8 
 
 
300 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  46.88 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.88 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.88 
 
 
296 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  44.98 
 
 
300 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  44.98 
 
 
300 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  47.57 
 
 
289 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  46.53 
 
 
290 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  47.77 
 
 
296 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  47.92 
 
 
325 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  44.64 
 
 
300 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  47.08 
 
 
297 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  46.8 
 
 
299 aa  252  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  47.22 
 
 
289 aa  251  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  46.74 
 
 
297 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 
312 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  44.67 
 
 
300 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  45.14 
 
 
289 aa  249  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  47.73 
 
 
298 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  45.52 
 
 
300 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  44.98 
 
 
300 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  45.21 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  44.33 
 
 
300 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 
295 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  45.83 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  41.11 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  40.07 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 
310 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 
325 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  44.11 
 
 
312 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  41.34 
 
 
308 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  39.42 
 
 
296 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  35.11 
 
 
297 aa  169  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 
299 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  32.29 
 
 
295 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  32.29 
 
 
295 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  32.64 
 
 
295 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 
295 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  36.94 
 
 
295 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 
304 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.36 
 
 
305 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  34.27 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
295 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
302 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 
295 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  31.27 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.69 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  36.98 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
295 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  33.69 
 
 
311 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
308 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 
313 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
308 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 
294 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 
466 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  32.29 
 
 
304 aa  142  8e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 
306 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 
315 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  32.36 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  31.25 
 
 
302 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>