More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4313 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2393 aa  4949    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  33.82 
 
 		 5854 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  34.03 
 
 		 2725 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  40.69 
 
 		 7157 aa  725    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  35.09 
 
 		 4036 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 		 1601 aa  628  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  47.68 
 
 		 4429 aa  606  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 		 5802 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  32.61 
 
 		 3525 aa  596  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  34.11 
 
 		 1440 aa  594  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  36.4 
 
 		 2727 aa  563  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  46.81 
 
 		 4539 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  47.05 
 
 		 4555 aa  536  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  33.61 
 
 		 1911 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  42.16 
 
 		 2653 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  35.03 
 
 		 5993 aa  520  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  34.32 
 
 		 5822 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  34.42 
 
 		 5778 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  35.23 
 
 		 5915 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  34.22 
 
 		 4212 aa  513  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  48.58 
 
 		 2726 aa  506  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  55.3 
 
 		 4614 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  34.5 
 
 		 6876 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 		 3231 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  44.96 
 
 		 4588 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  40.33 
 
 		 4869 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  51.36 
 
 		 5566 aa  482  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  43.62 
 
 		 5628 aa  477  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  40.65 
 
 		 3811 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  34.15 
 
 		 7149 aa  462  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  37.96 
 
 		 2501 aa  463  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.08 
 
 		 3696 aa  459  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.25 
 
 		 4478 aa  457  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  44.38 
 
 		 1315 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.56 
 
 		 3702 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 		 3693 aa  451  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 		 3693 aa  451  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.62 
 
 		 1656 aa  443  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  47.39 
 
 		 4649 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  48.08 
 
 		 3925 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  41.24 
 
 		 1696 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 		 2880 aa  439  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.19 
 
 		 3676 aa  439  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  41.65 
 
 		 4580 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  41.65 
 
 		 4101 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  42.72 
 
 		 591 aa  437  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  41.65 
 
 		 4098 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.03 
 
 		 3679 aa  437  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  41.46 
 
 		 4157 aa  434  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  39.97 
 
 		 4123 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  38.65 
 
 		 5612 aa  434  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  41.4 
 
 		 4122 aa  434  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  40.03 
 
 		 1474 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.38 
 
 		 3930 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.77 
 
 		 3645 aa  422  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.36 
 
 		 2762 aa  423  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  42.5 
 
 		 2462 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  44.64 
 
 		 1749 aa  417  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  38.35 
 
 		 1619 aa  416  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  31.97 
 
 		 3427 aa  416  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  38.92 
 
 		 2260 aa  413  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 		 2103 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 		 2333 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  40.62 
 
 		 4048 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.32 
 
 		 2363 aa  410  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 		 3176 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.09 
 
 		 2284 aa  409  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 2463 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  30.55 
 
 		 3781 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  33.26 
 
 		 6768 aa  403  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  31.98 
 
 		 7279 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  40.23 
 
 		 1262 aa  404  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  30.68 
 
 		 3780 aa  400  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  30.37 
 
 		 1613 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  42.33 
 
 		 1144 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  33.61 
 
 		 2006 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  33.45 
 
 		 3033 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.09 
 
 		 3099 aa  394  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 2551 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  31.95 
 
 		 5255 aa  390  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  32.14 
 
 		 4874 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  39.81 
 
 		 1272 aa  386  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  37.74 
 
 		 3449 aa  387  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40 
 
 		 1087 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  42.72 
 
 		 2230 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  31.59 
 
 		 3158 aa  384  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2376  Beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 		 1620 aa  384  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  39.81 
 
 		 1717 aa  383  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  42.14 
 
 		 2551 aa  383  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  31.92 
 
 		 2201 aa  383  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  32.32 
 
 		 5021 aa  383  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  32.25 
 
 		 5023 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  31.98 
 
 		 3463 aa  379  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  31.56 
 
 		 3695 aa  380  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 		 4882 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  31.84 
 
 		 3818 aa  380  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.81 
 
 		 1337 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 1939 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  32.55 
 
 		 2975 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.76 
 
 		 950 aa  377  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>