27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4260 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4260  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  335  2e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4586  hypothetical protein  99.38 
 
 
185 aa  334  3e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4870  hypothetical protein  90.74 
 
 
162 aa  305  1e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351623  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0679  hypothetical protein  83.95 
 
 
171 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.80583  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0710  hypothetical protein  83.95 
 
 
162 aa  290  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4506  hypothetical protein  83.95 
 
 
162 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256668  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0711  hypothetical protein  83.95 
 
 
162 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.19701  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40870  hypothetical protein  72.84 
 
 
168 aa  248  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.317722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5218  hypothetical protein  75.31 
 
 
162 aa  235  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60570  hypothetical protein  74.69 
 
 
162 aa  234  5e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.672607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5247  hypothetical protein  63.95 
 
 
168 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60960  hypothetical protein  63.95 
 
 
168 aa  196  1e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.775512  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0758  hypothetical protein  65.19 
 
 
168 aa  193  8e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2798  hypothetical protein  51.27 
 
 
159 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.822855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3341  hypothetical protein  41.14 
 
 
154 aa  119  2e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2202  hypothetical protein  39.24 
 
 
156 aa  116  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.666334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1332  hypothetical protein  40.99 
 
 
161 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00673232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0552  hypothetical protein  34.33 
 
 
154 aa  80.1  1e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78259e-05 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1997  hypothetical protein  35.62 
 
 
148 aa  79  2e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00184769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0539  hypothetical protein  33.58 
 
 
154 aa  78.6  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.0974e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2011  hypothetical protein  33.54 
 
 
162 aa  78.2  4e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2921  hypothetical protein  32.67 
 
 
154 aa  77.4  8e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  7.73857e-07 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0047  hypothetical protein  37.21 
 
 
165 aa  73.2  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0063  hypothetical protein  37.21 
 
 
165 aa  72.8  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0051  hypothetical protein  37.21 
 
 
165 aa  73.2  2e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2383  hypothetical protein  29.03 
 
 
157 aa  67  1e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.8196e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0048  hypothetical protein  34.88 
 
 
166 aa  67  1e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.232482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>