More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4217 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  100 
 
 
307 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  81.19 
 
 
316 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  68.46 
 
 
300 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  68.71 
 
 
297 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  67.45 
 
 
300 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  63.45 
 
 
299 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  65.19 
 
 
313 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  56.9 
 
 
300 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  52.92 
 
 
306 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  49.33 
 
 
319 aa  292  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  47.77 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  39.65 
 
 
297 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  36.61 
 
 
303 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  35.55 
 
 
298 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  37.64 
 
 
292 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  35.17 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  34.88 
 
 
298 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  34.81 
 
 
295 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  34.59 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  34.8 
 
 
304 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  33.71 
 
 
286 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  34.72 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  35.36 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  35 
 
 
296 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  34.69 
 
 
316 aa  152  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  31.51 
 
 
323 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  27.59 
 
 
339 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  30.24 
 
 
346 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  30.98 
 
 
348 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  30.51 
 
 
369 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  30.17 
 
 
320 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  27.67 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  32.78 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
292 aa  99  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  30.83 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  26.46 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.41 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  28.01 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  26.87 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  25 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  21.63 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  22.11 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  25.46 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.05 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  27.68 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.82 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.98 
 
 
265 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  25.37 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.65 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  25.72 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.3 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
364 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
431 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  25.41 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  26.71 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  25.93 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  27.07 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  25.82 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  27.84 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  22.48 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  27.09 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  27.09 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>