123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4048 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  97.21 
 
 
251 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  89.64 
 
 
251 aa  477  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  87.65 
 
 
251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  85.66 
 
 
251 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  85.66 
 
 
251 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  85.26 
 
 
251 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  83.19 
 
 
243 aa  420  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  80.99 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  77.69 
 
 
251 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  77.29 
 
 
251 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  52.63 
 
 
271 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  48.77 
 
 
277 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  221  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  47.95 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  45.15 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  44.73 
 
 
268 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  44.73 
 
 
268 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  48.09 
 
 
253 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  44.3 
 
 
268 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  44.3 
 
 
268 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  44.3 
 
 
268 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  43.46 
 
 
270 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  42.62 
 
 
271 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  43.46 
 
 
270 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  46.12 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45.66 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  44.3 
 
 
338 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  43.88 
 
 
272 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  43.88 
 
 
250 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  43.88 
 
 
250 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  43.88 
 
 
272 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  43.88 
 
 
272 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  43.88 
 
 
250 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  43.88 
 
 
301 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  45.66 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  41.18 
 
 
307 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  44.59 
 
 
278 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  44.59 
 
 
277 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  43.3 
 
 
249 aa  187  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  44.14 
 
 
277 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  42.11 
 
 
283 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  42.67 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  39.91 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  42.22 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  41.99 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  40.08 
 
 
285 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  39.47 
 
 
279 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  40.53 
 
 
286 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  38.31 
 
 
256 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  39.38 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  48.03 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  43.38 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  39.04 
 
 
286 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  38.8 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  38.53 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  38.8 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  38.43 
 
 
320 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.76 
 
 
277 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.76 
 
 
277 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.76 
 
 
277 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  32.91 
 
 
287 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  33.19 
 
 
283 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  32.62 
 
 
267 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  35.16 
 
 
265 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  31.33 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  32.35 
 
 
280 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  32.92 
 
 
291 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  36.07 
 
 
261 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  34.04 
 
 
288 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  32.91 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  34.17 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  34.15 
 
 
292 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  33.47 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  33.47 
 
 
291 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.57 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  34.68 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.42 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  28.86 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  31.58 
 
 
384 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  34.22 
 
 
297 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  34.92 
 
 
281 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  32.23 
 
 
337 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  34.26 
 
 
304 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  33.47 
 
 
316 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  30.49 
 
 
296 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  29.74 
 
 
270 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1892  putative hemolysin  30.49 
 
 
251 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185839  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4506  hypothetical protein  31.69 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.55 
 
 
261 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  33.06 
 
 
332 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1750  hypothetical protein  29.24 
 
 
276 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  31.71 
 
 
332 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  30.59 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  30.45 
 
 
337 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  32.44 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1906  putative hemolysin-like protein  28.95 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  33.74 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  35.12 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  30.86 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>