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for query gene Psyr_4004 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  94.18 
 
 
504 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
498 aa  977    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.64 
 
 
505 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  65.19 
 
 
501 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  63.98 
 
 
515 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.31 
 
 
483 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.64 
 
 
483 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.05 
 
 
483 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.99 
 
 
483 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.05 
 
 
526 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.05 
 
 
526 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  45.85 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  47.41 
 
 
520 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  47.19 
 
 
529 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 
522 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 
569 aa  290  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42 
 
 
554 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 
528 aa  281  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.95 
 
 
593 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 
504 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.84 
 
 
615 aa  273  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.6 
 
 
565 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.05 
 
 
535 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.84 
 
 
525 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
530 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.15 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  36.59 
 
 
494 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 
528 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
528 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.19 
 
 
523 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 
539 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.47 
 
 
685 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.42 
 
 
555 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.75 
 
 
519 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
565 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  36.26 
 
 
537 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.25 
 
 
509 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.5 
 
 
666 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 
504 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 
567 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.19 
 
 
641 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 
504 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 
680 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 
504 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.29 
 
 
504 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.5 
 
 
509 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.29 
 
 
504 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.49 
 
 
504 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.95 
 
 
918 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 
509 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 
509 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1152  major facilitator transporter  38.52 
 
 
516 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0257451  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.03 
 
 
519 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.21 
 
 
562 aa  256  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 
504 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.03 
 
 
504 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.03 
 
 
504 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.23 
 
 
501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 
621 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.78 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 
485 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 
504 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.66 
 
 
650 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 
697 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
685 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.36 
 
 
535 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.77 
 
 
676 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 
530 aa  249  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.35 
 
 
558 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 
678 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.97 
 
 
532 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 
572 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.87 
 
 
1062 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 
547 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.54 
 
 
513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.54 
 
 
513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 
513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 
522 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  36.34 
 
 
519 aa  246  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 
682 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.62 
 
 
528 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 
682 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 
682 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.27 
 
 
520 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  38.2 
 
 
530 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  36.81 
 
 
687 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  32.61 
 
 
513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  32.61 
 
 
513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.61 
 
 
513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
513 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
513 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.17 
 
 
538 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  37.47 
 
 
531 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
512 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 
513 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.69 
 
 
513 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 
513 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 
511 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
516 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 
539 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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