More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3864 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  92.85 
 
 		 811 aa  1555    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 811 aa  1650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  38.75 
 
 		 728 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 		 708 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 710 aa  341  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 718 aa  315  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 710 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 729 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 805 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  30.04 
 
 		 804 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  30.45 
 
 		 804 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 727 aa  277  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 712 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 730 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 819 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 802 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 710 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 808 aa  270  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 808 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 716 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 809 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 742 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 774 aa  263  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 729 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 804 aa  257  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 810 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 727 aa  252  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 810 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 810 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 706 aa  250  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.02 
 
 		 724 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 728 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 728 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  29.64 
 
 		 746 aa  243  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 724 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 727 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 754 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 726 aa  240  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 772 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 772 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.86 
 
 		 744 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 761 aa  235  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 725 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 728 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 810 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 800 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 722 aa  232  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 734 aa  231  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 879 aa  230  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 753 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.11 
 
 		 806 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 851 aa  228  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.63 
 
 		 797 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 749 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  28.93 
 
 		 771 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 726 aa  227  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 801 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 757 aa  226  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 839 aa  226  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  29.68 
 
 		 737 aa  224  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.92 
 
 		 704 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 737 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 828 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 801 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 755 aa  221  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 730 aa  221  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 729 aa  221  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 828 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 777 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 750 aa  215  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 828 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 823 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 802 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 698 aa  212  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 685 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 708 aa  212  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 762 aa  210  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 709 aa  209  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 797 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 702 aa  205  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 738 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 742 aa  204  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  28.31 
 
 		 730 aa  203  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 772 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 793 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 715 aa  202  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.83 
 
 		 833 aa  201  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 863 aa  200  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 707 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 728 aa  200  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 702 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 707 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 707 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.47 
 
 		 705 aa  198  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 724 aa  197  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.88 
 
 		 727 aa  197  9e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  26.95 
 
 		 763 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 858 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 855 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 855 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>