185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3785 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8164  hypothetical protein  40.46 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.170702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  32.51 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1792  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000899943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2002  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.42 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1759  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.42 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1737  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.42 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2023  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.42 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3421  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.42 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.42 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1780  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.87 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00151932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1918  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.87 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.017598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1954  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.87 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000322125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  30.37 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  27.08 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  26.77 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  28.89 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  24.47 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  25.67 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  26.09 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0131  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  25.13 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  24.21 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  24.44 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  25.53 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  26.32 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  26.48 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  24.87 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  24.47 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  25.53 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  25.38 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  25.57 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  24.47 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  22.87 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.87 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  24.47 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  24.6 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  22.4 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  26.06 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  23.4 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  21.74 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  22.62 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  26.7 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  25.98 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  24.88 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  27.06 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  23.2 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  17.48 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  22.93 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>