16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3766 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3766  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1614  hypothetical protein  84.27 
 
 		 179 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0254992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1279  hypothetical protein  40.96 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0389  hypothetical protein  35.58 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04900  hypothetical protein  32.74 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.475005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0594  hypothetical protein  33.67 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.464549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3986  hypothetical protein  29.7 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0163  hypothetical protein  36.94 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00127626  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4029  hypothetical protein  29.2 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3984  hypothetical protein  28.71 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3930  hypothetical protein  29.77 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1351  hypothetical protein  32.09 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0243  hypothetical protein  28.48 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0891  hypothetical protein  29.29 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3985  hypothetical protein  29.7 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0410  hypothetical protein  31.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>