35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3754 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  245  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  83.06 
 
 
125 aa  206  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  66.94 
 
 
121 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1243  hypothetical protein  68.85 
 
 
123 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.833895  normal  0.479275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  67.52 
 
 
119 aa  144  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3300  hypothetical protein  63.11 
 
 
128 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  60.53 
 
 
120 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0429  hypothetical protein  58.33 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1743  hypothetical protein  72.55 
 
 
122 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  48.41 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2757  hypothetical protein  55 
 
 
134 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  55.56 
 
 
119 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  50.45 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  53.78 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3370  hypothetical protein  63.87 
 
 
123 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2546  hypothetical protein  62.2 
 
 
123 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  decreased coverage  0.00618755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2217  hypothetical protein  62.5 
 
 
136 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.409261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  46.4 
 
 
121 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3169  hypothetical protein  60 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2134  hypothetical protein  46.83 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  43.4 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  43.3 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12081  hypothetical protein  39.81 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  43.48 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2166  hypothetical protein  44.21 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  38.14 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38480  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2022  hypothetical protein  33.91 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  33.68 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  36.36 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  34.48 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  34.48 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  33.72 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>