More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3733 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  48.39 
 
 
983 aa  846  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  52.32 
 
 
1033 aa  989  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  44.8 
 
 
991 aa  767  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  45 
 
 
995 aa  761  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  46.86 
 
 
1001 aa  840  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 
1038 aa  2096  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  73.17 
 
 
1028 aa  1513  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  60.38 
 
 
1004 aa  1199  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  94.51 
 
 
1055 aa  1967  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  47.36 
 
 
1001 aa  849  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.1 
 
 
1125 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  39.87 
 
 
1130 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  43.43 
 
 
1129 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  43.43 
 
 
1131 aa  366  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  43.23 
 
 
1131 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  43.23 
 
 
1131 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  43.23 
 
 
1131 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  43.23 
 
 
1129 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  43.64 
 
 
1131 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  35.23 
 
 
995 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  35.1 
 
 
986 aa  351  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 
1006 aa  332  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  37.65 
 
 
3506 aa  305  2e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.19 
 
 
1011 aa  303  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.47 
 
 
1029 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  35.21 
 
 
1119 aa  301  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  35.04 
 
 
1550 aa  283  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.25 
 
 
972 aa  278  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.24 
 
 
919 aa  276  2e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  35.82 
 
 
2371 aa  276  2e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  35.45 
 
 
2365 aa  274  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  35.91 
 
 
2366 aa  274  8e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  1.66918e-09 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  35.45 
 
 
2346 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.06 
 
 
1508 aa  272  3e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  35.55 
 
 
2396 aa  271  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.95 
 
 
1848 aa  265  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  32.25 
 
 
3954 aa  256  2e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.59 
 
 
1285 aa  255  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  32.95 
 
 
990 aa  255  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  34.39 
 
 
4238 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.22 
 
 
1227 aa  253  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  34.39 
 
 
3822 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.22 
 
 
4238 aa  252  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  31.36 
 
 
650 aa  241  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  34.03 
 
 
985 aa  233  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  33.28 
 
 
677 aa  231  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  30.91 
 
 
1881 aa  218  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.8 
 
 
915 aa  215  3e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.26 
 
 
2003 aa  215  3e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  31.9 
 
 
1782 aa  211  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1053 aa  211  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.25 
 
 
1164 aa  209  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.97 
 
 
913 aa  206  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 
994 aa  204  1e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.5 
 
 
926 aa  202  4e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  30.38 
 
 
1519 aa  201  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.08 
 
 
2711 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  34.22 
 
 
1016 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  35.68 
 
 
1056 aa  194  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  33.86 
 
 
1011 aa  193  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.59 
 
 
1156 aa  192  3e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.44 
 
 
1333 aa  192  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  27 
 
 
942 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  26.3 
 
 
998 aa  186  2e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  26.88 
 
 
970 aa  185  5e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.51 
 
 
1154 aa  184  9e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  31.45 
 
 
1062 aa  184  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  26.2 
 
 
970 aa  181  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  3.19801e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  29.03 
 
 
980 aa  181  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  26.1 
 
 
949 aa  177  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  4.85293e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.27 
 
 
1179 aa  175  3e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.22 
 
 
910 aa  175  4e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.8 
 
 
1152 aa  174  6e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.86 
 
 
965 aa  173  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.15 
 
 
906 aa  173  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  4.19199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.64 
 
 
954 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.64 
 
 
1134 aa  171  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  25.49 
 
 
974 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  26.7 
 
 
909 aa  168  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 
959 aa  162  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.7 
 
 
1081 aa  158  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  29.68 
 
 
816 aa  152  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.09 
 
 
1532 aa  149  4e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  24.37 
 
 
947 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  31.75 
 
 
1180 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  31.59 
 
 
488 aa  143  2e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  30.59 
 
 
1446 aa  142  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.05 
 
 
3629 aa  138  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.33 
 
 
1177 aa  132  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.15 
 
 
1769 aa  125  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.77 
 
 
1489 aa  125  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.02 
 
 
710 aa  121  5e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  26.35 
 
 
911 aa  119  2e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.56 
 
 
979 aa  119  4e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  27.67 
 
 
814 aa  116  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  28.79 
 
 
1459 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 
407 aa  106  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.06 
 
 
882 aa  104  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.06 
 
 
1066 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  35.24 
 
 
1325 aa  101  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>