More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3527 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  78.61 
 
 
388 aa  634    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  81.23 
 
 
400 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  94.16 
 
 
411 aa  787    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
411 aa  838    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  82.01 
 
 
400 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  80.72 
 
 
396 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  79.69 
 
 
400 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  74.75 
 
 
412 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  74.5 
 
 
412 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  74.26 
 
 
412 aa  631  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  74.26 
 
 
412 aa  631  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  74.5 
 
 
412 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.01 
 
 
412 aa  627  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  77.84 
 
 
387 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.01 
 
 
412 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  75.26 
 
 
412 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  75.26 
 
 
412 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  75.26 
 
 
412 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  75.26 
 
 
412 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  75 
 
 
412 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  74.48 
 
 
388 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.16 
 
 
386 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.91 
 
 
387 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  71.72 
 
 
390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50 
 
 
388 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  50.25 
 
 
394 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.34 
 
 
392 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  50.25 
 
 
394 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.7 
 
 
389 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  50 
 
 
394 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.68 
 
 
401 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 
386 aa  362  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.46 
 
 
397 aa  362  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.68 
 
 
389 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.17 
 
 
401 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.85 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.08 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  48.73 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  46.21 
 
 
399 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.68 
 
 
385 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.57 
 
 
384 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.36 
 
 
398 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  47.07 
 
 
389 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.67 
 
 
384 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.41 
 
 
389 aa  345  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.62 
 
 
376 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
395 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
389 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.36 
 
 
391 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
390 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.99 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.88 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
433 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.8 
 
 
389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.64 
 
 
393 aa  335  9e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.04 
 
 
389 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.78 
 
 
393 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 
384 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.56 
 
 
391 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.81 
 
 
391 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.62 
 
 
377 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
385 aa  332  7.000000000000001e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.98 
 
 
390 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  45.8 
 
 
389 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.45 
 
 
390 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  44.62 
 
 
377 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 
390 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.36 
 
 
377 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  45.73 
 
 
390 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.36 
 
 
377 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.36 
 
 
377 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.77 
 
 
389 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.36 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  44.36 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.19 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  44.36 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.73 
 
 
390 aa  329  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.06 
 
 
389 aa  328  7e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.96 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.36 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00340  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  46.75 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.349198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.78 
 
 
405 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.42 
 
 
390 aa  325  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 
391 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  44.42 
 
 
384 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
390 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.43 
 
 
393 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.15 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.82 
 
 
390 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.58 
 
 
390 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
382 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  45.32 
 
 
415 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554879  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  44.19 
 
 
391 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.48 
 
 
396 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.86 
 
 
389 aa  315  6e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  46.78 
 
 
391 aa  315  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.19 
 
 
382 aa  315  8e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>