59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3452 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  82 
 
 		 100 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  63.11 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  66.02 
 
 		 101 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  63.37 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  62.38 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  62.38 
 
 		 101 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  62.38 
 
 		 101 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  62.14 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  59.41 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  59 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  61.39 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  53.47 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  51.55 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  45.61 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  49.44 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  46.67 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  50 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.6 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  40.7 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  39.6 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  38 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  36 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  38.95 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  34.88 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  43.96 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.96 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  41.77 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  35.11 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  34.07 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0196  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0152  anti-sigma-factor antagonist  39.44 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  31.52 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  33.72 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  32.5 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  32.5 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  32.5 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  33.75 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3083  sulphate transporter  37.18 
 
 		 498 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0982983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.79 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.35 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  35.48 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  30.11 
 
 		 496 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0278  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 100 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 		 116 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>