More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3400 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 394 aa  804    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  83.11 
 
 		 384 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  83.65 
 
 		 389 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  63.24 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  56.36 
 
 		 389 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  56.36 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 		 376 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  56.18 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  52.43 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 		 385 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  44.77 
 
 		 377 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  44.77 
 
 		 376 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  44.96 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  44.96 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  42.2 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  46.52 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  45.7 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  43.12 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  43.39 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 385 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  43.73 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  35.4 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  43.75 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  34.4 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 373 aa  202  9e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 442 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 983 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 984 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.49 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  27.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  27.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  27.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  27.16 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  26.06 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 389 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 389 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  31.52 
 
 		 822 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.18 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 816 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 444 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 428 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 816 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 960 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  28.08 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 383 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 500 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.68 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 		 369 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.67 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 446 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 385 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>