283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3307 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  91.11 
 
 
405 aa  758    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
405 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  62.96 
 
 
405 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  60.76 
 
 
415 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  58.17 
 
 
402 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  60.51 
 
 
415 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  58.66 
 
 
402 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  60 
 
 
415 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  59.7 
 
 
415 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
402 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
436 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
402 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
410 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
399 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
399 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
432 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  26.6 
 
 
413 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
405 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
414 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  23.44 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  24.49 
 
 
396 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  24.37 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
405 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
404 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
411 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
406 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  32.6 
 
 
442 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.23 
 
 
429 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
403 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
1340 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
406 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
360 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
417 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
409 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
408 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
410 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
703 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  33.15 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  22.5 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
443 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  26.37 
 
 
408 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 
400 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
499 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
456 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  28.32 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.94 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.7 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  23.26 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  27.79 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  37.69 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.94 
 
 
860 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
1156 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
994 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
956 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  30.34 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
1106 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  24.55 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  26.93 
 
 
793 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.91 
 
 
537 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  24.16 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  24.28 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  33.33 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  30.5 
 
 
1119 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>