49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3170 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  78.79 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  63.64 
 
 		 99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  57.58 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  57.58 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  54.55 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  54.55 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  59.6 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  56.12 
 
 		 101 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  56.12 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  55.56 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.05 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  32.99 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  36.36 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.99 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563388  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.54 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  35.05 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  36.08 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.99 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  30.3 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  37.76 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  31.96 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  32.99 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  32.67 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  34.69 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1955  DsrH family protein  30.3 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.392226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  34.02 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000247543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  33.68 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  36.19 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2454  DsrH family protein  34.62 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000310745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  33 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  36.46 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  36.46 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  36.46 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  38.54 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  38.54 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  38.54 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  38.54 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  32.67 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  38.54 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  35.05 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  35.05 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  30.21 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  35.05 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2347  putative sulfur oxidation protein DsrH  29.29 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  34.52 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3760  sulfur transfer complex subunit TusB  29.29 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000801826  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  31.31 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>