More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3050 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3050  putative oxidoreductase  100 
 
 		 287 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378412  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3184  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  84.56 
 
 		 287 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11057  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6342  putative oxidoreductase  70.03 
 
 		 291 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4576  putative oxidoreductase  69.58 
 
 		 291 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0218  aldo/keto reductase  70.73 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  70.38 
 
 		 293 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2239  aldo/keto reductase  68.9 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1766  putative oxidoreductase  68.9 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1587  putative oxidoreductase  68.9 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  67.48 
 
 		 292 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2008  putative oxidoreductase  68.9 
 
 		 286 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.865157  normal  0.493035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1489  putative oxidoreductase  68.9 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2252  putative oxidoreductase  68.9 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1976  putative oxidoreductase  66.9 
 
 		 291 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0010  putative oxidoreductase  68.21 
 
 		 300 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737964  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3775  putative oxidoreductase  67.26 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4852  putative oxidoreductase  67.26 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2112  putative oxidoreductase  65.73 
 
 		 288 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1859  putative oxidoreductase  66.9 
 
 		 297 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6534  putative oxidoreductase  64.34 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.35079 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3959  putative oxidoreductase  65.85 
 
 		 290 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102223 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3561  putative oxidoreductase  68.1 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2776  putative oxidoreductase  66.78 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1935  aldo/keto reductase  67.13 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2685  aldo/keto reductase  64.46 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.346212  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6338  putative oxidoreductase  67.13 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4700  aldo/keto reductase  68.55 
 
 		 297 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0809909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2646  putative oxidoreductase  65.03 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6038  putative oxidoreductase  66.2 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.796364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0299  putative oxidoreductase  63.67 
 
 		 292 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876534  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  63.76 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  62.01 
 
 		 311 aa  345  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  63.03 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1340  aldo/keto reductase  59.36 
 
 		 293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  59.27 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1273  putative oxidoreductase  57.09 
 
 		 292 aa  324  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6751  aldo/keto reductase  57.41 
 
 		 275 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4941  aldo/keto reductase  50.86 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4436  aldo/keto reductase  53.85 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1135  aldo/keto reductase  51.39 
 
 		 294 aa  278  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4872  aldo/keto reductase  46.21 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4961  aldo/keto reductase  46.21 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5322  aldo/keto reductase  48.91 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5411  aldo/keto reductase  48.91 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5463  aldo/keto reductase  46.37 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5701  aldo/keto reductase  48.91 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1329  aldo/keto reductase  48.73 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398839  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  46.83 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01361  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  65.5 
 
 		 177 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01373  hypothetical protein  65.5 
 
 		 173 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  46.43 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0425  aldo/keto reductase  47.28 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3447  aldo/keto reductase  47.64 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  45.59 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  41.18 
 
 		 284 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  43.36 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5796  aldo/keto reductase  45.1 
 
 		 294 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869077  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2833  aldo/keto reductase  39.58 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  42.96 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  42.75 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  39.3 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  42.75 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  40.44 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5279  putative oxidoreductase  43.58 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  43.63 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  39.86 
 
 		 288 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  37.41 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0942  aldo/keto reductase  42.05 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  37.89 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  38.16 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  40.44 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  40.97 
 
 		 295 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  38.25 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  40 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  39.79 
 
 		 335 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  38.3 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  39.16 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  36.49 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  36.46 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  37.41 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  36.46 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3205  aldo/keto reductase  37.75 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0370321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  36.43 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  38.15 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5118  aldo/keto reductase  39.23 
 
 		 309 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.456075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0889  aldo/keto reductase  41.13 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0531022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  37.31 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  37.72 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  32.35 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  37.63 
 
 		 285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>