60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3046 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  90.34 
 
 		 207 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  38.65 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  37.37 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  37.56 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  36.55 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  35.23 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  31.72 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  32.22 
 
 		 253 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  30.94 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  31.46 
 
 		 248 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  31.35 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  32.12 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  34.66 
 
 		 233 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  31.72 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  34.22 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  32.12 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  30.64 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  30.64 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  30.86 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  30.86 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  30.06 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  32.22 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  29.48 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  30.17 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  29.33 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  30.77 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  27.07 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  33.12 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  27.37 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  25.91 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.52 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  25.79 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  28.73 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  29.32 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  25.13 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.88 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  25.79 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  23.53 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.14 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  26.26 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.04 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  31.16 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  31.18 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  27.32 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  25 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  26.94 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  29.8 
 
 		 232 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  28.33 
 
 		 188 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>