143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3041 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  93.82 
 
 
356 aa  678    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  100 
 
 
356 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  46.48 
 
 
360 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  46.52 
 
 
375 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  45.38 
 
 
350 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  44.23 
 
 
342 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  43.63 
 
 
354 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  44.9 
 
 
353 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  45.4 
 
 
351 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  45.51 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  45.92 
 
 
348 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  47.04 
 
 
356 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  44.09 
 
 
347 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  43.18 
 
 
347 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  44.41 
 
 
347 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  43.23 
 
 
349 aa  272  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  40.23 
 
 
403 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30670  Zinc metalloprotease (elastase)  48.65 
 
 
547 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  37.6 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  42.39 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  51.5 
 
 
207 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  36.4 
 
 
351 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  36.79 
 
 
565 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  38.65 
 
 
509 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  38.65 
 
 
509 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  37 
 
 
556 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  36.88 
 
 
566 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  37 
 
 
591 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  36.88 
 
 
566 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  36.88 
 
 
566 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  36.74 
 
 
556 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  36.63 
 
 
549 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  36.63 
 
 
554 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  36.63 
 
 
591 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  36.63 
 
 
591 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  36.63 
 
 
554 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  37.5 
 
 
556 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  37.4 
 
 
1031 aa  156  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  36.63 
 
 
549 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  37.12 
 
 
556 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  37.22 
 
 
547 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  35.53 
 
 
478 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  37.22 
 
 
552 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  38.55 
 
 
1017 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  36.84 
 
 
556 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  36.88 
 
 
566 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  36.5 
 
 
566 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  36.5 
 
 
566 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  36.5 
 
 
566 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  36.88 
 
 
566 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  36.65 
 
 
507 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  41.36 
 
 
566 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  41.36 
 
 
566 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  34.55 
 
 
546 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  36.33 
 
 
274 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  34.2 
 
 
532 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  31.37 
 
 
1154 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  31.53 
 
 
984 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  31.82 
 
 
567 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  32.2 
 
 
567 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2742  metalloendopeptidase  31.94 
 
 
567 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00888041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  32.2 
 
 
567 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2762  neutral protease  31.94 
 
 
388 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  32.2 
 
 
567 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  32.2 
 
 
567 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  32.2 
 
 
567 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2543  neutral protease  32.2 
 
 
567 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000016311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2730  neutral protease  32.2 
 
 
567 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476564  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  30.65 
 
 
568 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8540  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  33.69 
 
 
889 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810503  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  30.42 
 
 
565 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  30.42 
 
 
565 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  30.42 
 
 
565 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  31.42 
 
 
887 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  31.42 
 
 
893 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3392  bacillolysin  31.01 
 
 
565 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000112359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  30.42 
 
 
565 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  30.42 
 
 
565 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  32.35 
 
 
924 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  30.19 
 
 
890 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  29.64 
 
 
565 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  30 
 
 
565 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  29.7 
 
 
891 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  29.29 
 
 
565 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  29.29 
 
 
565 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  29.29 
 
 
565 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  29.29 
 
 
565 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  29.29 
 
 
565 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  29.21 
 
 
884 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  29.32 
 
 
891 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  29.21 
 
 
886 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  29.64 
 
 
565 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  29.64 
 
 
565 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  27.78 
 
 
527 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  29.64 
 
 
585 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  29.64 
 
 
585 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  29.64 
 
 
565 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  29.64 
 
 
585 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  30.97 
 
 
910 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  33.91 
 
 
543 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>