218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2986 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  65.66 
 
 
626 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  56.23 
 
 
619 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  94.05 
 
 
605 aa  1172    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 
610 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  54.81 
 
 
623 aa  663    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
605 aa  1244    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  54.98 
 
 
623 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  55.52 
 
 
617 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  55.12 
 
 
609 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  55.67 
 
 
610 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  58.83 
 
 
596 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  55.12 
 
 
609 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  65.66 
 
 
598 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  54.26 
 
 
608 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  54.71 
 
 
620 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  54.14 
 
 
619 aa  663    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  53.58 
 
 
596 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  55.5 
 
 
593 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  53.76 
 
 
613 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  54.95 
 
 
609 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  55.16 
 
 
611 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  55.12 
 
 
609 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  55.65 
 
 
609 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  54.14 
 
 
602 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 
610 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  54.8 
 
 
609 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 
610 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 
610 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 
610 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  55.67 
 
 
610 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  52.68 
 
 
629 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  53.97 
 
 
619 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  65.33 
 
 
598 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  52.81 
 
 
627 aa  634  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  55.5 
 
 
665 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  55.73 
 
 
611 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  54.45 
 
 
600 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  53.72 
 
 
626 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  54.68 
 
 
598 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  53.72 
 
 
626 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  51.72 
 
 
614 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  55.09 
 
 
616 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  52.77 
 
 
628 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  51.95 
 
 
629 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  53.2 
 
 
594 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  53.4 
 
 
586 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  53.57 
 
 
627 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  53.22 
 
 
597 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  53.22 
 
 
602 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  51.9 
 
 
601 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  52.33 
 
 
602 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  52.5 
 
 
602 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  52.16 
 
 
600 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  52.18 
 
 
601 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  52.97 
 
 
602 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  52.2 
 
 
598 aa  601  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  51.43 
 
 
605 aa  596  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  51.34 
 
 
599 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  54.07 
 
 
603 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 
597 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  53.57 
 
 
600 aa  589  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  50.6 
 
 
601 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  52.75 
 
 
601 aa  585  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  51.45 
 
 
610 aa  586  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  49 
 
 
629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 
602 aa  572  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  47.84 
 
 
596 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  48.05 
 
 
589 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  52.49 
 
 
727 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  45.95 
 
 
850 aa  525  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  45.76 
 
 
605 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  45.92 
 
 
593 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  44.66 
 
 
636 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  45.75 
 
 
592 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  46.64 
 
 
629 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  45.24 
 
 
592 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  45.21 
 
 
643 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  44.69 
 
 
596 aa  475  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  42.16 
 
 
639 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  41.64 
 
 
632 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  42.91 
 
 
604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  40 
 
 
612 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  41.52 
 
 
627 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  42.27 
 
 
625 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  39.12 
 
 
668 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  38.8 
 
 
672 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  39.58 
 
 
679 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  39.43 
 
 
642 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.58 
 
 
613 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  39.78 
 
 
662 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  39.6 
 
 
595 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  39.03 
 
 
677 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  39.03 
 
 
677 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  39.41 
 
 
599 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  39.87 
 
 
617 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.83 
 
 
617 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  38.87 
 
 
677 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  38.33 
 
 
607 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  38.83 
 
 
645 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  39.7 
 
 
596 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>