18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2893 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  100 
 
 		 222 aa  456  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  53.5 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  46.08 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  49.75 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  46.15 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  46.23 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  50.76 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  44.72 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  26.72 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1774  hypothetical protein  26.7 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  24.88 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  24.87 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  23.74 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  23.24 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  25.56 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  26.11 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2721  hypothetical protein  23.9 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>