More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2892 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  93.14 
 
 		 821 aa  1551    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  100 
 
 		 815 aa  1653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  47.89 
 
 		 811 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  40.75 
 
 		 842 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.71 
 
 		 832 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 883 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  39.95 
 
 		 884 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 		 804 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.17 
 
 		 800 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  35.16 
 
 		 840 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 849 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 833 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  38.72 
 
 		 784 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 847 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 843 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  39.25 
 
 		 800 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  36.79 
 
 		 788 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 795 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  34.76 
 
 		 961 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 818 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  37.09 
 
 		 835 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  37.96 
 
 		 795 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 788 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 816 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.83 
 
 		 799 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  37.45 
 
 		 795 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 853 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 842 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 811 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.36 
 
 		 811 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 797 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 793 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 803 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 803 aa  399  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 812 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 812 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 817 aa  396  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 813 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  35.84 
 
 		 793 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 812 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 885 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 797 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 815 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 933 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 871 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  33.04 
 
 		 797 aa  364  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  32.29 
 
 		 870 aa  361  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 924 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.74 
 
 		 856 aa  350  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 847 aa  347  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 873 aa  346  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 987 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 800 aa  339  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32 
 
 		 1015 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 817 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 858 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32.17 
 
 		 848 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 858 aa  328  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 850 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 861 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 852 aa  324  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 868 aa  323  7e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 853 aa  323  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 918 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 867 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 872 aa  320  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.26 
 
 		 867 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 887 aa  318  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 947 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.81 
 
 		 864 aa  313  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 857 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 851 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 948 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 869 aa  311  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 870 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 924 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.37 
 
 		 823 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 874 aa  303  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 879 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 867 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.62 
 
 		 948 aa  200  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 877 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 873 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 817 aa  114  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 842 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 873 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 836 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.89 
 
 		 839 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 869 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 841 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 866 aa  99  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 874 aa  97.8  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 944 aa  97.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 991 aa  94.4  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  35 
 
 		 884 aa  93.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 927 aa  93.2  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 871 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 883 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>