44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2881 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  100 
 
 		 255 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  95.69 
 
 		 255 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  48.87 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  50 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  50.19 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  50.19 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  34.25 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  33.33 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  34.64 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  31.79 
 
 		 307 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  30.25 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  31.62 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  30.04 
 
 		 395 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  29.12 
 
 		 934 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  28.79 
 
 		 477 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  28.34 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  25.61 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  23.72 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  24.42 
 
 		 789 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25 
 
 		 820 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  24.77 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  25.82 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  27.92 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  25.61 
 
 		 640 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  26.11 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  23.87 
 
 		 592 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  24.56 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  26.75 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  24.14 
 
 		 688 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  25.39 
 
 		 652 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  25 
 
 		 652 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  24.58 
 
 		 1242 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  30.09 
 
 		 619 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  33.72 
 
 		 814 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  26.21 
 
 		 405 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  24.22 
 
 		 599 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  25.25 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  38.3 
 
 		 354 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  23.18 
 
 		 494 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  25.52 
 
 		 487 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  23.79 
 
 		 1628 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  24.18 
 
 		 753 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  22.75 
 
 		 718 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  23.4 
 
 		 1066 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>