38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2779 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2779  Phage minor tail  100 
 
 
112 aa  234  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00996028  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  54.46 
 
 
112 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  48.62 
 
 
111 aa  114  7e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  46.79 
 
 
111 aa  113  1e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  46.43 
 
 
112 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  47.32 
 
 
112 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  42.59 
 
 
112 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  41.96 
 
 
112 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  43.52 
 
 
112 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3100  minor tail family protein  42.11 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.033574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2201  phage minor tail protein  42.98 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  41.82 
 
 
112 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  36.36 
 
 
113 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  36.36 
 
 
113 aa  77.4  7e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.22375e-05 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  36.45 
 
 
112 aa  74.3  5e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  36.36 
 
 
114 aa  67.8  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  35.9 
 
 
109 aa  55.8  2e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  31.82 
 
 
110 aa  53.1  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  34.21 
 
 
109 aa  53.1  1e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  31.82 
 
 
110 aa  53.1  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  28.04 
 
 
111 aa  53.5  1e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  34.21 
 
 
109 aa  52.4  2e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.52364e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  31.82 
 
 
110 aa  52.4  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  32.89 
 
 
109 aa  50.8  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47806e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  32.89 
 
 
109 aa  50.8  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  32.89 
 
 
109 aa  50.8  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  32.89 
 
 
109 aa  50.8  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  32.89 
 
 
109 aa  50.8  6e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  32.89 
 
 
109 aa  50.8  6e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  27.93 
 
 
109 aa  50.4  9e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  35.53 
 
 
109 aa  50.1  9e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  32.89 
 
 
109 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  33.93 
 
 
115 aa  49.7  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82073e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  32.89 
 
 
109 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  27.1 
 
 
109 aa  48.5  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  27.1 
 
 
109 aa  48.5  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  31.91 
 
 
117 aa  47.4  7e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  32.89 
 
 
113 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>