61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2772 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  39.27 
 
 
1133 aa  791  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  55.56 
 
 
1067 aa  953  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  49.04 
 
 
1100 aa  797  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  58.7 
 
 
1188 aa  1397  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  47.23 
 
 
1221 aa  1107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  47.83 
 
 
1816 aa  1050  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  49.05 
 
 
1061 aa  833  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  46.95 
 
 
1219 aa  1081  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  8.38912e-05 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  41.6 
 
 
1101 aa  868  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  41.85 
 
 
1092 aa  869  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  47.77 
 
 
1051 aa  799  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  45.41 
 
 
1341 aa  1114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  63.75 
 
 
2007 aa  1340  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  100 
 
 
1194 aa  2427  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  40.71 
 
 
1057 aa  657  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  28.49 
 
 
1543 aa  408  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0422e-05 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  32.61 
 
 
1103 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  6.19193e-10 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  34.14 
 
 
3238 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  33.42 
 
 
3521 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  33.87 
 
 
2899 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  33.03 
 
 
3286 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  33.16 
 
 
2900 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  33.86 
 
 
3006 aa  376  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  34.2 
 
 
2140 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  31.29 
 
 
1137 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  32.42 
 
 
1120 aa  363  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  31.94 
 
 
1120 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  32.05 
 
 
1116 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  31.07 
 
 
1132 aa  361  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  32.1 
 
 
1116 aa  359  2e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  30.93 
 
 
1132 aa  354  7e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  30.93 
 
 
1132 aa  354  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  31.21 
 
 
1159 aa  352  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  31.05 
 
 
1157 aa  351  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  31.09 
 
 
1159 aa  351  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  31.34 
 
 
1158 aa  347  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83265e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  31.34 
 
 
1158 aa  347  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  30.41 
 
 
1159 aa  344  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  31.1 
 
 
1159 aa  343  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  30.7 
 
 
1157 aa  342  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  30.4 
 
 
1157 aa  340  1e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  27.49 
 
 
1059 aa  317  1e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17932e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  35.85 
 
 
1093 aa  305  4e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  33.29 
 
 
1093 aa  305  4e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  31.6 
 
 
1012 aa  289  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  35.41 
 
 
522 aa  282  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  28.86 
 
 
881 aa  199  4e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  36.6 
 
 
951 aa  182  5e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  24.7 
 
 
960 aa  150  2e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  26.82 
 
 
837 aa  146  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  36.02 
 
 
1830 aa  118  8e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  42.74 
 
 
348 aa  94  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  32.32 
 
 
2400 aa  62  6e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.47967e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  21.53 
 
 
1644 aa  55.8  5e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  26.37 
 
 
1089 aa  51.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2375  hypothetical protein  26.92 
 
 
643 aa  47.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00246528  unclonable  3.74805e-08 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 
3333 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  29.47 
 
 
2402 aa  46.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  29.63 
 
 
683 aa  46.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  30 
 
 
2401 aa  45.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  30 
 
 
2437 aa  45.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.265366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>