89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2703 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  85.53 
 
 		 394 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  58.93 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  55.46 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  55.59 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  55.37 
 
 		 814 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  53.8 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  50.56 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  50.83 
 
 		 422 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  51.93 
 
 		 412 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  51.54 
 
 		 783 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  48.21 
 
 		 783 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  46.5 
 
 		 1293 aa  326  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  45.6 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  45.05 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  38.61 
 
 		 443 aa  229  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  31.05 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  24.88 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  35.2 
 
 		 741 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  31.99 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  32.35 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  31.62 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  33.8 
 
 		 751 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  31.49 
 
 		 754 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  30.45 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.79 
 
 		 1119 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  27.55 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  30.73 
 
 		 374 aa  106  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 		 705 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  25.14 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  28.1 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.3 
 
 		 477 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  32.24 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 729 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.17 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  25.08 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 903 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.88 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  29.88 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  24.23 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  28.53 
 
 		 728 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 728 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  33.58 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  23.5 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  27.8 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  21.18 
 
 		 942 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  26.64 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  30.53 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  27.35 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.45 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  26.67 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 726 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 859 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.71 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>