30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2659 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  870  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  29.63 
 
 
435 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  29.63 
 
 
435 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  29.86 
 
 
216 aa  63.9  5e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  61.2  4e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  28.51 
 
 
216 aa  58.5  2e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  31.21 
 
 
182 aa  58.2  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  34.33 
 
 
174 aa  55.5  2e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  30.15 
 
 
236 aa  53.5  6e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  7.86691e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  27.09 
 
 
169 aa  52.4  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  40 
 
 
184 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  26.13 
 
 
173 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  43.84 
 
 
182 aa  47  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  38.81 
 
 
295 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  33.87 
 
 
173 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  40.68 
 
 
181 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  8.37307e-07  unclonable  1.39166e-06 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  48.33 
 
 
289 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  38.81 
 
 
295 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  38.81 
 
 
295 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  37.86 
 
 
171 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  31.4 
 
 
296 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  31.11 
 
 
283 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  8.44609e-09  hitchhiker  2.8574e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  32.22 
 
 
246 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  34.21 
 
 
175 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  43.55 
 
 
291 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  27.06 
 
 
188 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  32.28 
 
 
186 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  2.14852e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  26.02 
 
 
383 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  28.65 
 
 
177 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  38.89 
 
 
257 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  1.66978e-06  normal  0.022054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>