34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2627 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  90.66 
 
 		 407 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  56.27 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  51.6 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  52.01 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  39.01 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  35.91 
 
 		 397 aa  206  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  38.14 
 
 		 408 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  38.61 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  32.26 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  30.81 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  30.56 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  31 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  31.27 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 609 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 700 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 930 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.26 
 
 		 851 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  38.24 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  42.42 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  38.24 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.07 
 
 		 850 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.73 
 
 		 1232 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.92 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  25.56 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.63 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24 
 
 		 947 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.35 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 		 838 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.99 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.99 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>