More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2592 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  100 
 
 
343 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2668  transport system permease protein  69.39 
 
 
349 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  59.48 
 
 
343 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2938  transport system permease protein  60.93 
 
 
343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  54.97 
 
 
343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
352 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  46.67 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  45.54 
 
 
352 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
352 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  45.86 
 
 
352 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.86 
 
 
352 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  45.86 
 
 
352 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  46.35 
 
 
352 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.86 
 
 
352 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  43.27 
 
 
350 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  45.4 
 
 
348 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1041  transport system permease protein  51 
 
 
348 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  39.43 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  39.43 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  43.53 
 
 
351 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  41.32 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  41.5 
 
 
346 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  41.5 
 
 
346 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  45.98 
 
 
346 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  46.42 
 
 
344 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
338 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  38.79 
 
 
338 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 
338 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  38.79 
 
 
338 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  38.79 
 
 
338 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  38.79 
 
 
338 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
338 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  37.88 
 
 
338 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2493  transport system permease protein  41.93 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.357055 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
340 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  34.16 
 
 
337 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  34.16 
 
 
337 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  37.46 
 
 
338 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  38.65 
 
 
338 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  37.06 
 
 
338 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  45.17 
 
 
644 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  35.26 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  36.48 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  35.26 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  36.74 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  36.74 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  36.74 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  35.9 
 
 
338 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  44.3 
 
 
351 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7289  ABC transporter  44.34 
 
 
327 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  38.91 
 
 
318 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.94 
 
 
678 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
342 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
342 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  37.38 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01764  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  39.94 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  37.38 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.94 
 
 
678 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  32.85 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  38.05 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  32.85 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  32.85 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  34.51 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  37.27 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.66 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  31.78 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.74 
 
 
678 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.89 
 
 
323 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  41.03 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
340 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.64 
 
 
678 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.64 
 
 
678 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  39.41 
 
 
323 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.64 
 
 
678 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  36.66 
 
 
345 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  36.66 
 
 
345 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  36.66 
 
 
342 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  36.66 
 
 
342 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40 
 
 
365 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  37.59 
 
 
342 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  29.65 
 
 
340 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  40.87 
 
 
367 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.42 
 
 
678 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  35.74 
 
 
332 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  37.17 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  32.61 
 
 
328 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>