More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2591 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  100 
 
 		 329 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  69.4 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  59.38 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  59.19 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  53.11 
 
 		 336 aa  322  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  52.88 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  48.56 
 
 		 333 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  47.84 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  44.87 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  47.84 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  47.84 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  47.48 
 
 		 334 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  47.48 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  47.84 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  43.73 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  43.41 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  48.56 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  48.56 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  48.2 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  48.2 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  40.91 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  40.91 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  43.69 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  46.28 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  44.1 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  48.69 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  41.33 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.11 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  42.81 
 
 		 340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  44.81 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  40.51 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  44.73 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  39.63 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 343 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  39.94 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  39.63 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  39.94 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  41.45 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 		 351 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  40.46 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  40.31 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  43.38 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  44.88 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  40.19 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  45.48 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  41.18 
 
 		 350 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.48 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.48 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.48 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  45.48 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.48 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  41.9 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  43.99 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.48 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  45.48 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.48 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  43.54 
 
 		 347 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  41.08 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  39.43 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  41.97 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  35.05 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  44.3 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  36.7 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  36.7 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  35.05 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  40.06 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  42.37 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.12 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.54 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  33.55 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.53 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  44.44 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  41.1 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.47 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  34.41 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  34.41 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  34.41 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  42.55 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  41.3 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.28 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.28 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.28 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  35.05 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0330  transport system permease protein  40.13 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  39.53 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  39.53 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  38.71 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0382  iron compound ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>