More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2491 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  56.14 
 
 
677 aa  717  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  67.82 
 
 
732 aa  992  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.94 
 
 
731 aa  663  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  53.66 
 
 
736 aa  748  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  47.27 
 
 
731 aa  663  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  72.65 
 
 
736 aa  1117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  52.62 
 
 
712 aa  733  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  54.57 
 
 
725 aa  785  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.87 
 
 
721 aa  812  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  50 
 
 
729 aa  688  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  50.56 
 
 
634 aa  656  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.18 
 
 
732 aa  716  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  50.42 
 
 
743 aa  733  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  51.34 
 
 
764 aa  729  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.76 
 
 
635 aa  695  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.25 
 
 
754 aa  693  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.7482e-05  decreased coverage  4.47753e-07 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  50.21 
 
 
755 aa  697  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  54.18 
 
 
728 aa  791  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  49.93 
 
 
763 aa  719  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  54.02 
 
 
728 aa  790  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  48.63 
 
 
742 aa  686  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  62.31 
 
 
732 aa  919  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  53.55 
 
 
727 aa  783  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.35 
 
 
1217 aa  660  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  65.92 
 
 
712 aa  966  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  2.8583e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  50.28 
 
 
745 aa  728  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  52.91 
 
 
728 aa  772  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.81 
 
 
741 aa  663  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.62 
 
 
737 aa  756  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.93 
 
 
768 aa  807  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.99 
 
 
742 aa  691  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  47.12 
 
 
756 aa  673  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  48.19 
 
 
755 aa  702  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  47.34 
 
 
754 aa  686  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  46.65 
 
 
754 aa  671  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  53.33 
 
 
748 aa  731  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  52.73 
 
 
725 aa  747  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  57.09 
 
 
728 aa  830  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  53.19 
 
 
642 aa  663  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  50.28 
 
 
743 aa  731  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  57.12 
 
 
728 aa  814  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  50.33 
 
 
1240 aa  729  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.79 
 
 
721 aa  740  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.27 
 
 
659 aa  684  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  47.89 
 
 
741 aa  681  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  47.98 
 
 
765 aa  711  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  46.17 
 
 
754 aa  663  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  46.74 
 
 
759 aa  665  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  57.49 
 
 
738 aa  819  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  57.63 
 
 
738 aa  820  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.3 
 
 
729 aa  797  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.42 
 
 
730 aa  762  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  53.05 
 
 
728 aa  779  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  53.19 
 
 
728 aa  778  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  53.19 
 
 
728 aa  779  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  52.42 
 
 
716 aa  734  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  47.68 
 
 
750 aa  685  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.94 
 
 
785 aa  812  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  60.19 
 
 
727 aa  861  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  55.88 
 
 
728 aa  790  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  59.76 
 
 
768 aa  903  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  50 
 
 
766 aa  732  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.88 
 
 
631 aa  696  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  47.03 
 
 
730 aa  654  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  49.33 
 
 
782 aa  700  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  50.42 
 
 
743 aa  733  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  52.75 
 
 
735 aa  754  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  59.33 
 
 
737 aa  863  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.64 
 
 
742 aa  817  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  54.02 
 
 
728 aa  789  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.29 
 
 
735 aa  713  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  53.05 
 
 
728 aa  777  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  53.19 
 
 
728 aa  779  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  46.99 
 
 
1320 aa  666  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.25 
 
 
739 aa  752  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  61.43 
 
 
736 aa  894  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  53.88 
 
 
728 aa  786  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  49.46 
 
 
782 aa  702  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  54.02 
 
 
728 aa  790  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  53.69 
 
 
727 aa  787  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  72.93 
 
 
736 aa  1122  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.29 
 
 
732 aa  713  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.23 
 
 
784 aa  806  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  53.69 
 
 
727 aa  786  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  58.44 
 
 
732 aa  840  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  6.52942e-05 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.97 
 
 
728 aa  724  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  50.42 
 
 
743 aa  734  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  48.24 
 
 
759 aa  679  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  54.02 
 
 
728 aa  789  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  72.47 
 
 
736 aa  1125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.65 
 
 
760 aa  798  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  60.33 
 
 
741 aa  861  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.32 
 
 
747 aa  684  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  50.96 
 
 
732 aa  723  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.04 
 
 
633 aa  677  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  58.65 
 
 
733 aa  835  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.14 
 
 
728 aa  785  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  57.24 
 
 
736 aa  828  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.23 
 
 
770 aa  817  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.33 
 
 
741 aa  663  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>