86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2459 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  82.63 
 
 
236 aa  407  1e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  67.8 
 
 
236 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  65.68 
 
 
232 aa  320  1e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  62.71 
 
 
236 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  63.14 
 
 
236 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  62.29 
 
 
236 aa  304  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  59.75 
 
 
236 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  61.02 
 
 
236 aa  296  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  58.9 
 
 
288 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  54.04 
 
 
238 aa  254  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 
236 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  38.91 
 
 
230 aa  148  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 
229 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 
234 aa  128  7e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  35.56 
 
 
229 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
223 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
234 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 
244 aa  112  4e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  31.78 
 
 
220 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
224 aa  112  7e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
236 aa  112  7e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  33.05 
 
 
236 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
250 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
224 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
224 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  31.56 
 
 
235 aa  108  9e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
224 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  30.4 
 
 
244 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
224 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
222 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
223 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
223 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.84 
 
 
224 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
224 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
224 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
222 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
225 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
227 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
224 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.45 
 
 
222 aa  92.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
211 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  26.78 
 
 
231 aa  70.9  2e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
209 aa  66.2  4e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
220 aa  57  3e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
237 aa  52.8  4e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 
203 aa  52.4  7e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  26.72 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  25.89 
 
 
202 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  24 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0422  phosphoglycerate mutase 1 family protein  34.44 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  23.87 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  35.06 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  24.14 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  23.87 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  30.43 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0981  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.632698 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  34.67 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.23 
 
 
203 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.61375e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
250 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
250 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
250 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  33.77 
 
 
247 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  24.74 
 
 
208 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
250 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>