More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2452 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  94.44 
 
 
270 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  77.24 
 
 
270 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  76.12 
 
 
270 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  75.37 
 
 
270 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  72.76 
 
 
280 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  72.39 
 
 
270 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  75.37 
 
 
270 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  71.64 
 
 
280 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  74.63 
 
 
270 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  54.51 
 
 
273 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  53.36 
 
 
270 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.11 
 
 
967 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.76 
 
 
284 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.42 
 
 
279 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.32 
 
 
291 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.17 
 
 
286 aa  249  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.45 
 
 
284 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.01 
 
 
286 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.61 
 
 
276 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.16 
 
 
277 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  42.26 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.52 
 
 
275 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
274 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
283 aa  214  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.05 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 
273 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
281 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  41.25 
 
 
291 aa  198  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  39.55 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 
253 aa  165  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
258 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.79 
 
 
260 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.97 
 
 
260 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.83 
 
 
255 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
257 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
260 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.82 
 
 
662 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
253 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
260 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
260 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.71 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 
259 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  138  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.33 
 
 
256 aa  139  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.34 
 
 
659 aa  138  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
277 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.78 
 
 
258 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
258 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
269 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
260 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
267 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30 
 
 
657 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
260 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
264 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.58 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
257 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
260 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.36 
 
 
661 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.59 
 
 
662 aa  132  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
259 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
259 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
259 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>