125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2393 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  100 
 
 		 194 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  93.81 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  68.95 
 
 		 192 aa  287  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  69.11 
 
 		 196 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  69.11 
 
 		 196 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  69.11 
 
 		 196 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  67.36 
 
 		 197 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  69.47 
 
 		 194 aa  280  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  69.27 
 
 		 192 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  64.43 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  64.43 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  64.43 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.03 
 
 		 192 aa  278  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  67.57 
 
 		 189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  63.92 
 
 		 195 aa  264  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  62.5 
 
 		 194 aa  259  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  64.32 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  53.57 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  52.15 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.55 
 
 		 215 aa  194  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.72 
 
 		 193 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.72 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  51.58 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  49.22 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.2 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  45.81 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  45.56 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  43.55 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  43.75 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  68.87 
 
 		 118 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.131105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  41.21 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  41.21 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  41.21 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.76 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  41.21 
 
 		 189 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  41.21 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  41.21 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.09 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.15 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  27.62 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30.68 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.62 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.11 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  27.22 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  26.67 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.62 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  23.76 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.33 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  24.12 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.84 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  28 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.7 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.76 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.14 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  23.49 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  27.12 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25.28 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.07 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  25.14 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  30.14 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  23.86 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  21.55 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.4 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.44 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.29 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.14 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  27.32 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.58 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 393 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  26.49 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  26.67 
 
 		 430 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  28.73 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.14 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  26.59 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  27.7 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.72 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.71 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.79 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28.57 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  25.15 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  23.36 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>