More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2379 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 437 aa  846    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  65.65 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  64.93 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  62.5 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  62.74 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  62.74 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  59.91 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  62.62 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  58.89 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  62.32 
 
 		 449 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  47.32 
 
 		 452 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  55.58 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  45.23 
 
 		 446 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  46.81 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  48.95 
 
 		 446 aa  349  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  47.38 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  45.48 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  44.67 
 
 		 474 aa  325  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  49.38 
 
 		 506 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  44.31 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  44.36 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  43.95 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  41.03 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  43.51 
 
 		 473 aa  285  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  41.65 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  41.68 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  44.94 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  42.12 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 		 470 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 		 470 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  40.31 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  40.87 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  41.53 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  35.12 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  36.41 
 
 		 436 aa  192  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  35.16 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  34.77 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  34.69 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  34.47 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  31.24 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  33.58 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  33.42 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 467 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 467 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.57 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.57 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.67 
 
 		 489 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 494 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.83 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.83 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  30.04 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.25 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.13 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.55 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.25 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.55 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 500 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 485 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  29.03 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 495 aa  123  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  26.67 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  30.75 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  30.75 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  30.75 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  29.58 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  30.75 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  27 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  30.75 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 503 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  28.04 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  27.29 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.42 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>