More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2360 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2360  CBS  100 
 
 
146 aa  290  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  89.04 
 
 
146 aa  261  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  77.4 
 
 
144 aa  223  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  4.81482e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  76.03 
 
 
146 aa  223  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  76.03 
 
 
144 aa  219  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  72.6 
 
 
145 aa  219  1e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  72.6 
 
 
145 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  71.23 
 
 
145 aa  213  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  71.92 
 
 
145 aa  213  6e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  57.53 
 
 
147 aa  163  6e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  55.48 
 
 
146 aa  163  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  56.85 
 
 
147 aa  162  2e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  56.16 
 
 
158 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  54.55 
 
 
153 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  54.55 
 
 
153 aa  158  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  53.85 
 
 
153 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  57.24 
 
 
146 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  53.15 
 
 
153 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  53.15 
 
 
153 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  53.15 
 
 
153 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  54.11 
 
 
146 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  53.79 
 
 
145 aa  153  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  54.48 
 
 
144 aa  154  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  53.1 
 
 
145 aa  151  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  54.48 
 
 
142 aa  151  3e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  50.35 
 
 
153 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  53.15 
 
 
143 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  51.05 
 
 
142 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  52.74 
 
 
146 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  51.75 
 
 
153 aa  146  1e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  53.1 
 
 
146 aa  145  2e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  53.1 
 
 
146 aa  145  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 
154 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 
154 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 
154 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 
154 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 
154 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 
154 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 
154 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  51.56 
 
 
140 aa  143  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  50.68 
 
 
149 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  48.28 
 
 
163 aa  138  2e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  48.95 
 
 
145 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  48.94 
 
 
143 aa  136  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  46.9 
 
 
164 aa  136  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  51.56 
 
 
145 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  47.26 
 
 
143 aa  132  1e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  46.94 
 
 
146 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  4.47829e-06  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  44.83 
 
 
142 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  51.72 
 
 
120 aa  124  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  42.76 
 
 
142 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  43.45 
 
 
147 aa  119  1e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  43.26 
 
 
141 aa  119  1e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  42.86 
 
 
155 aa  119  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  42.47 
 
 
148 aa  117  4e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  55 
 
 
104 aa  108  2e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  40 
 
 
177 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  36.8 
 
 
147 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  40.14 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  41.96 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.26 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  36.84 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  40.88 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  36.11 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.54 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  41.41 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  40.74 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  42.99 
 
 
688 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  42.99 
 
 
688 aa  93.2  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.32 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.2 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  36.62 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.97093e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  40.14 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  40.6 
 
 
182 aa  90.1  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  37.32 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  39.86 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  39.67 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  33.1 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  41.55 
 
 
143 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.94 
 
 
141 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.65197e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  38.03 
 
 
143 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  34.51 
 
 
142 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.07 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  37.5 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  36.62 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  40.91 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  34.07 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  33.8 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  39.83 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.68 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.58 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  35.11 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  35.11 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
143 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.07 
 
 
145 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>