140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2350 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  88.16 
 
 		 152 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  67.11 
 
 		 155 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  63.16 
 
 		 152 aa  209  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.67 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  52.67 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  48.37 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  46.36 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  51.47 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  47.71 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  52.21 
 
 		 162 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  47.95 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  41.67 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  45 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  45.77 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.14 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.14 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  39.87 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  40.51 
 
 		 174 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  42.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  35.95 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.61 
 
 		 196 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.57 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  64.91 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  38.19 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  37.06 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.21 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.57 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  33.77 
 
 		 173 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.91 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  34.67 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.25 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  32.7 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  35.71 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  35.33 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.17 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.28 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  41.25 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  31.94 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.88 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  32.52 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.49 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.35 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  29.25 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.13 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.86 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.68 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  28 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.7 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  28.08 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  27.63 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.61 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  26.97 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.81 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  31.34 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.65 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  31.88 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  29.68 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.48 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.14 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  26.51 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.87 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  29.93 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.11 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.12 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  25.3 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.44 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.24 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.03 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  28.99 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  30.92 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  31.3 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  29.79 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  28.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  28.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  28.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.87 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  28.21 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  28.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.35 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.93 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.45 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.27 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.91 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  28.24 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.3 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  27.67 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>