More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2335 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  94.15 
 
 
342 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  100 
 
 
342 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  75.44 
 
 
339 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  64.84 
 
 
366 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  63.76 
 
 
356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  64.84 
 
 
365 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  62.57 
 
 
368 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  60.72 
 
 
363 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  60.45 
 
 
363 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  60.11 
 
 
360 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  60.67 
 
 
363 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  58.99 
 
 
360 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  58.99 
 
 
360 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  58.71 
 
 
360 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  61.85 
 
 
348 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  58.71 
 
 
360 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 
351 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  54.39 
 
 
359 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  53.26 
 
 
359 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  53.16 
 
 
356 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  52.57 
 
 
356 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  50.57 
 
 
362 aa  359  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  52.65 
 
 
364 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  49.72 
 
 
356 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  50.14 
 
 
355 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  53.43 
 
 
350 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.65 
 
 
347 aa  335  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.6 
 
 
347 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  48.85 
 
 
353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  49.56 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  48.88 
 
 
358 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  49.27 
 
 
362 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.88 
 
 
352 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.29 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.9 
 
 
379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  48.82 
 
 
372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 
353 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 
343 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.94 
 
 
353 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 
370 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47.16 
 
 
366 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.58 
 
 
353 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  47.94 
 
 
372 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 
353 aa  298  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 
363 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  47.46 
 
 
353 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
384 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.27 
 
 
362 aa  295  6e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.85 
 
 
447 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  45.77 
 
 
353 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.53 
 
 
372 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.98 
 
 
353 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.2 
 
 
356 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.84 
 
 
331 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.74 
 
 
370 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
331 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.22 
 
 
364 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.7 
 
 
361 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.48 
 
 
359 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.97 
 
 
356 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.6 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 
372 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  46.7 
 
 
381 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.35 
 
 
372 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
387 aa  285  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  46.88 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  46.59 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.72 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.92 
 
 
353 aa  282  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.25 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.16 
 
 
383 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.32 
 
 
374 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.51 
 
 
365 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
367 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.59 
 
 
338 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.42 
 
 
372 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.34 
 
 
356 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  51.07 
 
 
364 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.4 
 
 
349 aa  279  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
377 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  48.1 
 
 
352 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 
360 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  47.78 
 
 
352 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.08 
 
 
356 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  47.79 
 
 
344 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 
369 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 
355 aa  278  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  50 
 
 
527 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.13 
 
 
376 aa  278  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.02 
 
 
408 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  49 
 
 
328 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.35 
 
 
355 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  49.16 
 
 
329 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  46.22 
 
 
341 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  44.41 
 
 
359 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
359 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  47.78 
 
 
352 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
349 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  44.63 
 
 
364 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  43.68 
 
 
350 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>