220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2302 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  100 
 
 
438 aa  903    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  60.65 
 
 
438 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  60.14 
 
 
438 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.64 
 
 
440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  59.49 
 
 
438 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  51.36 
 
 
437 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.26 
 
 
447 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  48.28 
 
 
432 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  45.08 
 
 
444 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.09 
 
 
437 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.11 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  46.21 
 
 
432 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.54 
 
 
435 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.92 
 
 
433 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.82 
 
 
432 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  40.28 
 
 
430 aa  331  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 
433 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  42.18 
 
 
436 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  40.59 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  40.71 
 
 
443 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  44.29 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.58 
 
 
441 aa  309  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  38.48 
 
 
436 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  39.21 
 
 
440 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  40.78 
 
 
442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  36.79 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  36.79 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 
444 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  40.42 
 
 
472 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  40.55 
 
 
444 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  35.9 
 
 
468 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  39.17 
 
 
442 aa  266  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.4 
 
 
454 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  40.63 
 
 
432 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  38.89 
 
 
464 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  37.13 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
455 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.22 
 
 
453 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  35.35 
 
 
481 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.24 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 
476 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  34.7 
 
 
461 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 
474 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.95 
 
 
472 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  33.87 
 
 
456 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.87 
 
 
456 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.87 
 
 
456 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 
463 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31.09 
 
 
431 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  30.73 
 
 
431 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 
445 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27.46 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  28.25 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  28.48 
 
 
452 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  30.22 
 
 
473 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  25.32 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 
461 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.04 
 
 
761 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  25.17 
 
 
471 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.68 
 
 
490 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  24.68 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.84 
 
 
478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.84 
 
 
478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.84 
 
 
478 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.84 
 
 
471 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  30.17 
 
 
578 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  29.17 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  31.43 
 
 
437 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  27.21 
 
 
478 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.54 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.49 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  29.53 
 
 
456 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  29.53 
 
 
472 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  26.57 
 
 
441 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  30.22 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 
474 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.08 
 
 
1023 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.21 
 
 
1023 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  28.19 
 
 
474 aa  53.5  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.36 
 
 
1005 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.66 
 
 
491 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.19 
 
 
485 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.74 
 
 
473 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  23.83 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.83 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  31.11 
 
 
974 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  26.81 
 
 
433 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.91 
 
 
1006 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 
471 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  27.33 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  26.13 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 
474 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  28.96 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.06 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  30.46 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 
472 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  29.88 
 
 
499 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>