59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2300 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  51.96 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  53.29 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  34.3 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  30.86 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  37.88 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  40.3 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  38.08 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  34.23 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  30.45 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  24.72 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  36.63 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  25.1 
 
 		 318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  32 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  40.87 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  37.3 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  37.3 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  26.19 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  27.85 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  27.85 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.66 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  29.15 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.65 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.9 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  25.91 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  24.81 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  25.91 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  27.78 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.77 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  25.19 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  36 
 
 		 859 aa  49.3  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  30.32 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  32.67 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  30.1 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  28.25 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  29.02 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  36.63 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  32.8 
 
 		 793 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  30.86 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  28.26 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  23.49 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.16 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25.39 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.86 
 
 		 783 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  30.63 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  24.44 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  21.11 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  31.43 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  26.01 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  20.63 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  26.95 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  27.63 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  34.69 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  27.82 
 
 		 385 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  27.97 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  32.43 
 
 		 840 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  32.43 
 
 		 840 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>