More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2295 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  95.52 
 
 
603 aa  1110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  100 
 
 
603 aa  1204  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  4.65139e-05 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  62.4 
 
 
611 aa  751  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  58.67 
 
 
609 aa  719  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  60.03 
 
 
604 aa  736  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  46.05 
 
 
623 aa  507  1e-142  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 
621 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
621 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  46.15 
 
 
621 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  47.89 
 
 
625 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  47.8 
 
 
625 aa  467  1e-130  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  46.98 
 
 
625 aa  460  1e-128  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  42.5 
 
 
608 aa  439  1e-122  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  40.34 
 
 
611 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
616 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  41.07 
 
 
619 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  41.59 
 
 
618 aa  418  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  41.59 
 
 
618 aa  408  1e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  41.59 
 
 
618 aa  407  1e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  40.2 
 
 
615 aa  401  1e-110  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  40.4 
 
 
615 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  42.69 
 
 
638 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  41.37 
 
 
623 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 
626 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  38.01 
 
 
613 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  35.69 
 
 
592 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  36.73 
 
 
614 aa  353  6e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.13 
 
 
600 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  36.2 
 
 
613 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  35.23 
 
 
626 aa  329  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  37.41 
 
 
606 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  33.72 
 
 
618 aa  313  6e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  36.18 
 
 
621 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  35.35 
 
 
605 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  35.63 
 
 
608 aa  297  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  34.69 
 
 
616 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.72 
 
 
616 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.18 
 
 
619 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.69 
 
 
608 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  29.24 
 
 
597 aa  281  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.0922e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  33.94 
 
 
626 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  32.86 
 
 
605 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  35.84 
 
 
578 aa  271  3e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.77 
 
 
566 aa  271  3e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
662 aa  270  6e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 
633 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  34.22 
 
 
595 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  32.29 
 
 
606 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  34.88 
 
 
633 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  37.65 
 
 
599 aa  246  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  32.65 
 
 
623 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.19 
 
 
587 aa  242  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  30.96 
 
 
611 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.62 
 
 
594 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  24.96 
 
 
591 aa  233  7e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  38.05 
 
 
631 aa  233  7e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  27.89 
 
 
618 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  34.21 
 
 
665 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.26 
 
 
596 aa  228  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  31.65 
 
 
627 aa  227  5e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.86 
 
 
619 aa  224  5e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02067e-07 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  43.01 
 
 
604 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  33.33 
 
 
673 aa  223  1e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  37.67 
 
 
500 aa  222  2e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  30.54 
 
 
596 aa  222  2e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.84 
 
 
603 aa  222  2e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  25.84 
 
 
603 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  32.04 
 
 
647 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  28.24 
 
 
619 aa  220  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  30.59 
 
 
617 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  38.56 
 
 
626 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.35 
 
 
582 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.35 
 
 
582 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  34.12 
 
 
653 aa  215  2e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.03 
 
 
582 aa  215  2e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  36.78 
 
 
590 aa  214  3e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.21 
 
 
582 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  28.43 
 
 
604 aa  207  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  28.26 
 
 
593 aa  206  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.01983e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.42 
 
 
605 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 
597 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  29.71 
 
 
611 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.27 
 
 
619 aa  203  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 
582 aa  202  1e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.03 
 
 
582 aa  202  1e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 
582 aa  201  2e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.44 
 
 
582 aa  201  2e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  30.54 
 
 
634 aa  202  2e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>