32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2293 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2489  hypothetical protein  94.38 
 
 
358 aa  697  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2293  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  734  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934293  decreased coverage  3.60604e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3749  hypothetical protein  72.21 
 
 
362 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.793318  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3970  putative lipoprotein  67.05 
 
 
367 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0988  hypothetical protein  66.48 
 
 
367 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29270  putative outer membrane lipoprotein  66.38 
 
 
367 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03430  DUF1615 family hypothetical protein  68.51 
 
 
396 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3805  hypothetical protein  62.29 
 
 
350 aa  469  1e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1964  hypothetical protein  62.86 
 
 
350 aa  470  1e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44514  normal  0.164812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0410  hypothetical protein  65.97 
 
 
365 aa  465  1e-130  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2086  hypothetical protein  63.14 
 
 
350 aa  464  1e-130  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2111  hypothetical protein  63.04 
 
 
350 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.255855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0450  putative lipoprotein  61.19 
 
 
364 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0491  protein of unknown function DUF1615  63.56 
 
 
365 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00329  hypothetical protein  61.56 
 
 
364 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.368977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00325  predicted DNA-binding transcriptional regulator  61.56 
 
 
364 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3254  hypothetical protein  61.56 
 
 
364 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0402  putative lipoprotein  61.56 
 
 
364 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3230  protein of unknown function DUF1615  61.56 
 
 
364 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0443  putative lipoprotein  61.56 
 
 
364 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0412  putative outer membrane lipoprotein  59.38 
 
 
364 aa  451  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  hitchhiker  0.00807805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0413  putative outer membrane lipoprotein  59.38 
 
 
364 aa  451  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0407  putative lipoprotein  61.27 
 
 
364 aa  453  1e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0419  hypothetical protein  59.66 
 
 
364 aa  452  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0473  hypothetical protein  59.38 
 
 
364 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0295  putative lipoprotein  60.98 
 
 
364 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0431  putative outer membrane lipoprotein  59.38 
 
 
364 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.718831  normal  0.526755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0847  hypothetical protein  63.89 
 
 
366 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04182  lipoprotein, putative  56.94 
 
 
363 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4181  hypothetical protein  44.68 
 
 
390 aa  325  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1490  protein of unknown function DUF1615  31.83 
 
 
376 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.776486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1489  hypothetical protein  30.4 
 
 
368 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>