More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2290 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  100 
 
 
800 aa  1611  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  5.69019e-05 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  45.47 
 
 
788 aa  642  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  1.20084e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  45.84 
 
 
795 aa  644  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  46.55 
 
 
795 aa  644  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 
788 aa  638  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  4.56142e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  48.96 
 
 
784 aa  680  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  95.5 
 
 
800 aa  1550  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  42.96 
 
 
793 aa  574  1e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  42.96 
 
 
793 aa  574  1e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  41.72 
 
 
843 aa  558  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  41.82 
 
 
795 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  41.92 
 
 
799 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  38.68 
 
 
853 aa  506  1e-142  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  40.41 
 
 
812 aa  506  1e-142  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.60682e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  40.41 
 
 
812 aa  507  1e-142  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 
797 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.41597e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 
812 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  38.88 
 
 
803 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 
797 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.61093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  39.25 
 
 
803 aa  505  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  39.6 
 
 
797 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 
797 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.40414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  41.03 
 
 
811 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  38.32 
 
 
817 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  38.59 
 
 
884 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  40 
 
 
883 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  39.88 
 
 
800 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  39.39 
 
 
821 aa  472  1e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.78 
 
 
811 aa  471  1e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 
811 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 
815 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  37.81 
 
 
847 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  39.25 
 
 
815 aa  459  1e-128  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  39.02 
 
 
797 aa  459  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 
817 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  36.85 
 
 
823 aa  441  1e-122  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  34.83 
 
 
1015 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 
933 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 
835 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 
804 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 
847 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 
868 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  36.8 
 
 
848 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  35.24 
 
 
840 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 
818 aa  416  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  34.47 
 
 
867 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  7.92676e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  34.04 
 
 
856 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.15 
 
 
832 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 
948 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  32.59 
 
 
864 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 
853 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 
851 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 
918 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 
857 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  33.37 
 
 
961 aa  386  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 
858 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 
861 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 
842 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  33.37 
 
 
874 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 
813 aa  372  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 
816 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 
871 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
869 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 
887 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 
947 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 
870 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  6.3349e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 
877 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.78647e-05  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
924 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 
842 aa  362  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 
833 aa  361  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  31.36 
 
 
870 aa  358  3e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  1.76254e-05  unclonable  3.3388e-08 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 
885 aa  353  6e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 
987 aa  350  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 
858 aa  349  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 
849 aa  341  3e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 
924 aa  327  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 
850 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 
852 aa  315  3e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 
873 aa  299  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 
879 aa  285  3e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 
872 aa  261  5e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 
867 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 
867 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  30.96 
 
 
948 aa  218  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
867 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
867 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
867 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
867 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
861 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.24466e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
861 aa  158  5e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.02099e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
861 aa  158  5e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.1652e-05  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
874 aa  151  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
866 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  27.15 
 
 
827 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
849 aa  145  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  7.02632e-05  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
836 aa  142  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
869 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.50471e-05  decreased coverage  5.82733e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
876 aa  137  1e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  9.50091e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.81 
 
 
853 aa  133  2e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
927 aa  131  4e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>